貝類研究家　故遠藤晴雄氏が収集した貝類コレクション50,000点の寄贈をうけ、国内外の貴重な貝を常時展示している。また、同２階には、海の学校(要予約）も開校しており、三ツ石海岸に生息する磯の生き物等の指導・説明も行っている。