本寺は萬昌院と功運寺の合併寺で，創建年代は萬昌院が天正2年（1574）功運寺が慶長3年（1598）。桜田門外に創建され芝三田功運町に移転大正11年に中野区に移転，吉良上野介の墓などがある。