雷公神社に伝わる知内町最古の古文書「大野土佐日記」によれば、元久2年(1205)、砂金を求めて甲斐の国(山梨県)からこの地に来た荒木大学が天下泰平と当所の安全を祈願し、賀茂の上社と下社の二社を創建した時に始まると伝えられる北海道でもっとも古い神社です。古来より、恋の成就を願う人がここでお参りすると、相手に心が通じると言い伝えられている神社でもあります。