九十九里教会は1887年（明治20年）に建てられた教会で、教会堂は登録有形文化財に指定されている。創立期に応援伝道のためにこの地を訪れていた宣教師ヘボンが、建設に際して寄付金を自ら供し、設計にも関わったものとされ、日本では早い時期に建てられた教会であり、後の木造ゴシックの教会とは若干趣を異にしている。毎週日曜日に礼拝が行われ、毎月第一木曜日に祈祷会が行われています。